Effet de la manipulation de la biodiversité microbienne sur les processus d’oxydation des gaz traces dans le sol

Saavedra-Lavoie, Julien (2019). Effet de la manipulation de la biodiversité microbienne sur les processus d’oxydation des gaz traces dans le sol Mémoire. Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en microbiologie appliquée, 53 p.

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Résumé

La protection de la biodiversité vise à supporter le fonctionnement des écosystèmes ainsi que les biens et services qu’ils procurent. La relation entre la biodiversité et la fonctionnalité demeure néanmoins complexe, surtout à l’échelle des microorganismes qui sont dotés d’une forte redondance fonctionnelle. Ce projet a été élaboré afin d’évaluer la susceptibilité de quatre fonctions à une altération de la biodiversité microbienne du sol. Ces fonctions comprenaient deux fonctions généralistes, soient le profil d'utilisation de diverses sources de carbone organique et la respiration du dioxyde de carbone (CO2), et deux fonctions spécialistes, soient l'oxydation du dihydrogène (H2) et l'oxydation du monoxyde de carbone (CO). Une manipulation de la biodiversité fut réalisée par trois différents rapports d’un mélange de sol forestier non stérile : stérile (1:4, 1:20 et 1:40), en présence ou non de deux antibiotiques. Les microcosmes de sol ont été incubés sous atmosphère contrôlée, assurant la disponibilité de l’H2 et du CO durant leur colonisation par les microorganismes. Le séquençage d’amplicons de PCR du gène codant pour l’ARNr 16S des bactéries a montré que la composition, et non la richesse spécifique des communautés microbiennes avait été influencée par les traitements. Malgré l’absence d’extinction d’espèce, les fonctions spécialisées ont diminué avec des baisses atteignant 94% par rapport au sol non dilué, alors que les fonctions généralistes n'ont pas été atténuées. Ces résultats montrent la complexité du fonctionnement des écosystèmes tout en proposant l’analyse de la susceptibilité des guildes microbiennes fonctionnelles à une altération de la biodiversité pour élaborer nouveaux outils de protection de l'environnement.

Type de document:	Thèse Mémoire
Directeur de mémoire/thèse:	Constant, Philippe
Mots-clés libres:	Écologie microbienne; gaz traces; microbiologie; dihydrogène; monoxyde de carbone
Centre:	Centre INRS-Institut Armand Frappier
Date de dépôt:	09 juill. 2024 15:28
Dernière modification:	09 juill. 2024 15:28
URI:	https://espace.inrs.ca/id/eprint/15820

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