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Caractérisation taxonomique des communautés microbiennes associées à l'agrile du frêne (AGF), Agrilus planipennis

Mogouong, Judith . Caractérisation taxonomique des communautés microbiennes associées à l'agrile du frêne (AGF), Agrilus planipennis In: Congrès Armand-Frappier 2017 (10e édition), 9-11 novembre 2017, Orford (Québec).

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Résumé

L’agrile du frêne est un insecte ravageur s’alimentant dans le phloème et causant d’importants dommages à toutes les essences de frênes présentes en Amérique du Nord. Les insectes sont connus comme étant des vecteurs d’une communauté microbienne pouvant leur permettre de survivre et de s’adapter à leur environnement. La structure de cette communauté microbienne symbiotique peut être influencée par plusieurs facteurs. D’une part les variables environnementales peuvent être responsables des structures spatiales de l’assemblage d’espèces (contrôle abiotique) et d’autre part, ces structures spatiales peuvent aussi être générées par les autocorrélations dans les structures (contrôle biotique). L’objectif du projet était de mettre en évidence la dynamique des communautés microbiennes associées au tract intestinal de l’agrile du frêne face au facteur de densité de populations d’insectes. Pour ce faire, un échantillonnage a été effectué sur des arbres ayant des niveaux d’infestations variés (endémiques à épidémiques). Des données ont été générées à partir du séquençage d’extraits d’ADN du tract intestinal des insectes (Illumina MiSeq). Le traitement des données avec des outils bioinformatiques a permis de générer des Unités Taxonomiques Opérationnelles (OTU) pour réaliser des analyses quantitatives multidimensionnelles avec le logiciel R. Des éléments de la dynamique des communautés microbiennes que représentent ces espèces d’OTU associées à l’insecte ont été mis en évidence. Ainsi, on a pu analyser les interactions entre les indices de diversité et la densité des insectes dans l’arbre, les corrélations entre la densité de l’insecte et des facteurs spécifiques des arbres hôtes. Cette étude apporte des informations essentielles dans la compréhension de la dynamique des communautés microbiennes associées à l’insecte sous l’influence de pressions externes. Elle ouvre des perspectives intéressantes dans un contexte de développement d’outils de lutte biologique.

Type de document: Document issu d'une conférence ou d'un atelier
Mots-clés libres: -
Centre: Centre INRS-Institut Armand Frappier
Date de dépôt: 16 déc. 2019 20:56
Dernière modification: 16 déc. 2019 20:56
URI: http://espace.inrs.ca/id/eprint/8244

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