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Lamp: an appropriate technology for point-of-care (POC) application in medical diagnostics.

Nahar, Sharifun (2014). Lamp: an appropriate technology for point-of-care (POC) application in medical diagnostics. Mémoire. Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en sciences de l'énergie et des matériaux, 85 p.

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Résumé

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Dans le domaine du diagnostic médical, les applications points de soins (PDS) sont simples à utiliser, portables, disponibles, et stables dans différentes conditions de fonctionnement. Les instruments automatiques robotisés à haut-débit de traitement ne sont généralement pas accessibles ou réalisables dans les milieux à faibles ressources qui manquent d'infrastructures dans les laboratoires. Bien que de nombreuses méthodes sont déjà établis pour le diagnostic médical, elles ne sont pas toutes adaptées pour le diagnostic aux points de soins. Les méthodes d'amplification d'acides nucléiques sont très sensibles et spécifiques en raison de l'amplification de la cible et des interactions d'appariement de bases. Au cours de la réaction en chaîne polymérase (PCR), l'amplification isotherme de l'ADN / ARN a récemment suscité de l'intérêt, car elle ne nécessite pas un thermocycleur. LAMP (Loop-mediated isothermal amplification) est une technique d'amplification isotherme, considérée comme une méthode robuste en termes de sensibilité, de tolérance avec des substances inhibitrices présentes dans l'échantillon réel, et qui permet la détection du résultat avec l'oeil nu. Par conséquent, il s'agit d'une approche plus efficace et plus simple, ce qui en fait un excellent choix pour les applications de points de soins (PDS). J'ai développé un étui en plastique à faible coût en utilisant des sacs en plastique (par exemple, les sacs à fermeture zip simples) pour la détection du virus d'herpès simplex (HSV). J'ai incorporé la méthode LAMP dans cette pochette de plastique et j'été capable de détecter 6,08 x 101 copies / µI de HSV-I ADN et 0.598 copies / µl de HSV-2 ADN dans 45 minutes.

Abstract

The symbols and special characters used in the original abstract could not be transcribed due to technical problems. Please use the PDF version to read the abstract.

In the field of medical diagnostics, point-of-care (POC) applications are simple to use, portable, easily disposable, and stable under different operating conditions. A high-throughput, automated robotic processing instrument is generally not affordable or feasible in low-resource settings that lack the necessary laboratory infrastructure. Though many methods are already established for medical diagnostics, not all of them are suitable for point-of-care diagnostics. Nucleic acid amplification methods are very sensitive and specific due to target amplification and base-pairing interactions. Over polymerase chain reaction (PCR), the isothermal amplification of DNA/RNA has recently drawn interest since it does not require a large thermal cycler. LAMP (Loop mediated isothermal amplification) is an isothermal amplification technique and considered as a robust method in terms of sensitivity, tolerance to inhibitory substances present in the real sample, and easy naked eye detection. Therefore, it is a simpler and more energy efficient approach, making it an excellent choice for POC applications. l developed a low cost plastic pouch using a plastic bag (e.g. simple re-sealable zipper storage bag) for the detection of Herpes Simplex Viruses (HSV). The LAMP method was easily incorporated into this plastic pouch and allowed the detection of 6.08 x 101 copies/µl of HSV -1 DNA and 0.598 copies/ill of HSV-2 DNA within 45 minutes. Since the LAMP method is less sensitive to inhibitory substances present in the real sample, we also could detect viral DNA without purifying it. The result was easily evaluated -colorimetrically using the naked eye via the addition of hydroxynaphthol blue (HNB) dye in the reaction mix. Therefore, colorimetric detection by the naked eye makes for easy result analysis. -The lack of need for expensive instruments and its low cost and portability make this invension a perfect candidate for point-of-care (POC) diagnosis both in the laboratory and in low-resource countries.

Type de document: Mémoire
Directeur de mémoire/thèse: Vetrone, Fiorenzo
Informations complémentaires: Résumé avec symboles
Mots-clés libres: point de service (PDS); LAMP; virus d'herpès simplex (HSV); HNB colorant; détection colorimétrique; le sachet en plastique.
Centre: Centre Énergie Matériaux Télécommunications
Date de dépôt: 23 sept. 2014 20:37
Dernière modification: 25 nov. 2015 14:52
URI: http://espace.inrs.ca/id/eprint/2375

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