Développement de nouvelle technologie de bio-détection de microorganismes par l’utilisation d’oligonucléotides et d’aptamères

Yurdusev, Emre (2018). Développement de nouvelle technologie de bio-détection de microorganismes par l’utilisation d’oligonucléotides et d’aptamères Mémoire. Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, maîtrise en microbiologie appliquée, 77 p.

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Résumé

Les aptamères sont des acides nucléiques, qui de par leur structure tridimensionnelle, sont capables de reconnaître et lier spécifiquement une molécule donnée. À partir d'une banque d'oligonucléotides, les séquences présentant de telles particularités aptamériques peuvent être sélectionnées grâce à une méthode d'évolution accélérée in-vitro, nommée SELEX. Le SELEX est un processus qui, à travers les sélections positives et négatives constituant ses cycles, permet de moduler précisément l’affinité des aptamères sélectionnés pour une haute sélectivité envers des cibles données et une capacité à discriminer ces cibles de molécules très similaires.

Pour cette raison, entre autres, il existe un nombre grandissant de publications concernant le développement de nouveaux aptamères envers différentes cibles. Nous avons premièrement mis en examen la reproductibilité de résultats publiés concernant l’affinité d’un certain nombre d’aptamères envers des cibles bactériennes, dans l’objectif de constituer pour nos travaux avenirs une banque d’aptamères bactériens dont la fonctionnalité a été approuvée entre ‘nos mains’.

Le développement de plateformes de bio-détection en conjuguant des oligonucléotides à des senseurs à fibres optiques a constitué le deuxième volet de nos travaux, en lien avec le premier, car la preuve de concept apportée servira également à l’utilisation des aptamères sur ce type de plateforme.

Aptamers are nucleic acids able to recognize and bind specific molecules due to their three dimensional structures. Sequences with such aptameric particularities can be selected from an oligonucleotide bank using an in vitro accelerated selection method, named SELEX. SELEX is a process constituted of positive and negative selection cycles that allow one to precisely modulate the affinity of the selected aptamers with high selectivity against a given target, and the capacity to discriminate this target from other even very similar molecules.

For this reason, among others, there is an exponentially growing number of publications with regard to the development of new aptamers against different types of targets. First, we have tested the reproducibility of published results concerning the affinity of a certain number of aptamers against their bacterial targets with the objective of establishing a bank of aptamers whose functionality have been confirmed in ‘our hands’ to use in our future studies.

The development of a bio-sensor platform through the immobilization of oligonucleotides on optic-fiber sensor surfaces was the second aim of our project. This second part of the project is linked to the first one by the fact that it paves the way to a proof of concept for the utilization of aptamers using this type of platform.

Type de document:	Thèse Mémoire
Directeur de mémoire/thèse:	Perreault, Jonathan
Mots-clés libres:	-
Centre:	Centre INRS-Institut Armand Frappier
Date de dépôt:	17 mars 2024 19:53
Dernière modification:	17 mars 2024 19:53
URI:	https://espace.inrs.ca/id/eprint/15313

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